Kolesterol yüksekliğinde insanlarda direk baş ağrısı belirtisi olmaz. Ancak kolesterolün vücutta yaptığı etkilerin yansıması olarak, damar tıkanıklığının olması durumunda baş ağrısı belirtisi görülebilir. Çünkü damar tıkanıklığında vücutta kan akımının azalması söz konusu olur. Beyne giden kan akımında sorun olursa, baş ağrıları daha etkili olabilir. Bu yüzden kolesterol problemi yaşayan kişilerde baş ağrısı görüldüğünde, mutlaka doktora gidilerek kontrol altında olunmalıdır. Bu kolesterol yüksekliği nedeniyle ortaya çıkabilecek inme gibi önemli bir sorunun işareti de olabilir.

Damarlarda biriken (LDL) kötü kolesterol plaklara neden olmuş, bir sebepten dolayı plaklarda çatlama olmuş olabilir. Bunlar kolesterolün neden olduğu önemli sorunlardan biridir. Özellikle diyabet hastalarında yaygın şekilde görülen damar kireçlenmesinin eşlik etmesi nedeniyle kolesterol baş ağrısıyla birlikte etkili olabilir. Çünkü beyin olması gerektiği gibi kanlanmaya sahip olamaz. Beyne gidecek kan miktarının azalmış olması, hatta damarların bir kısmında kan akımının kesilmesiyle dokulardaki oksijenlenme azalmaktadır. Bu durumda kolesterolün etkilemesiyle birlikte baş ağrısının görülmesi normal kabul edilir. Bu durum acilen müdahale edilecek bir sorundur. Damarların bir pıhtıyla tıkanması bile felce, ölüme gidecek kadar önemli bir soruna sebep olabilir. Özellikle ileri yaştaki kişiler bu konuda daha fazla risk taşımaktadır. Alınacak önlemler sayesinde, kolesterolün neden olacağı baş ağrısı ve diğer sorunlar önlenebilir.